FIP ITSNU Pasuruan didirikan berdasarkan SK Rektor Nomor I.072018/R/KP.00.3/019/2018 pada tanggal 16 Mei 2018. Berdasarkan urutannya, FIP merupakan fakultas kedua dari tiga fakultas di ITSNU Pasuruan. Pendirian FIP dilatarbelakangi dari hasil sinergi kolaboratif antara pendidikan tinggi dan pendidikan pesantren. Pada awal berdiri sampai sekarang FIP berlokasi di Kampus ITSNU Pasuruan di Warungdowo, Kabupaten Pasuruan. Sejak awal berdiri FIP memiliki tiga program studi yaitu: (1) Program Studi S1 Pendidikan Biologi; (2) Program Studi S1 Pendidikan Fisika; dan (3) Program Studi S1 Pendidikan Matematika.
